Nhiệm vụ- Tổ chức nghiên cứu cơ bản về hai quần đảo Hoàng Sa, Trường Sa trên các lĩnh vực kinh tế, chính trị, lịch sử, văn hóa, xã hội, quốc phòng, an ninh, đối ngoại…, hướng đến góp phần tư vấn, định hướng chính sách phát triển kinh tế biển, đảo vùng duyên hải miền Trung; khẳng định chủ quyền và đấu tranh bảo vệ chủ quyền của Việt Nam đối với Hoàng Sa, Trường Sa.
- Tham gia đào tạo, bồi dưỡng cán bộ thông qua việc tích hợp những kết quả nghiên cứu để xây dựng tài liệu tham khảo, chuyên đề giảng dạy trong chương trình đào tạo, bồi dưỡng ở Học viện.
- Phối hợp với các đơn vị thuộc Học viện Chính trị quốc gia Hồ Chí Minh, các trường đại học, viện nghiên cứu, sở khoa học và công nghệ, liên hiệp các hội khoa học và kỹ thuật các tỉnh, thành khu vực miền Trung - Tây Nguyên tổ chức nghiên cứu, đánh giá kết quả, nghiệm thu và ứng dụng kết quả nghiên cứu vào thực tiễn phục vụ phát triển bền vững kinh tế biển, đảo vùng duyên hải miền Trung.
- Phối hợp với các cơ quan, đơn vị, các nhà khoa học trong nước và nước ngoài tổ chức và tham gia các hội thảo khoa học, diễn đàn học thuật liên quan đến vấn đề chủ quyền của Việt Nam đối với Hoàng Sa, Trường Sa; về phát triển kinh tế biển, đảo và bảo vệ chủ quyền biển, đảo Việt Nam.
- Tham mưu, đề xuất thực hiện các hợp đồng dịch vụ tư vấn, xây dựng luận cứ khoa học, phản biện các chương trình, dự án phát triển kinh tế - xã hội; đề xuất chính sách, giải pháp liên quan đến phát triển kinh tế biển, đảo gắn với bảo đảm quốc phòng, an ninh vùng duyên hải miền Trung, bảo vệ chủ quyền của Việt Nam đối với Hoàng Sa, Trường Sa.
- Tập hợp, biên tập và giới thiệu các tài liệu liên quan đến chủ quyền của Việt Nam đối với Hoàng Sa, Trường Sa phục vụ công tác đào tạo cán bộ, nghiên cứu khoa học, thông tin, tuyên truyền; phổ biến kết quả nghiên cứu khoa học và truyền bá kiến thức khoa học khẳng định chủ quyền của Việt Nam đối với Hoàng Sa, Trường Sa.
- Tổ chức các khóa bồi dưỡng và tuyên truyền cho cán bộ, viên chức của các tổ chức Đảng, Nhà nước, Mặt trận Tổ quốc Việt Nam và nhân dân về các lĩnh vực liên quan đến chủ quyền biển, đảo, đấu tranh bảo vệ chủ quyền biển, đảo Việt Nam, trong đó có Hoàng Sa, Trường Sa.
- Quản lý, xây dựng đội ngũ cán bộ, viên chức của Trung tâm về mọi mặt, thực hiện chế độ, chính sách, công tác thi đua - khen thưởng và kỷ luật đối với cán bộ, viên chức của đơn vị theo thẩm quyền; thực hiện phòng và chống tham nhũng, lãng phí, tiêu cực trong đơn vị theo quy định; quản lý, bảo quản và sử dụng có hiệu quả tài chính, tài sản, các loại hồ sơ, tài liệu được giao.
- Thực hiện các nhiệm vụ khác do Giám đốc Học viện Chính trị quốc gia Hồ Chí Minh và Giám đốc Học viện Chính trị khu vực III phân công.